В соответствии с правилом Шатского, согласно которому обширные осадочные бассейны образуются над прекратившими свое развитие рифтами, можно считать, что в основании Восточно-Черноморской впадины также находится рифт. В этой связи необходимо решить вопросы, когда произошло заложение основных разломов, характеризующих стадию рифтинга, который привел, в конечном итоге, к образованию впадины Черного моря.

На материалах сейсморазведки МОГТ видно, что образование, в результате перемещений по сбросу, ступени в нижней части юго-западного склона вала Шатского произошло в доэоценовое время, т.к. на сейсмических разрезах эоценовые отложения, прослеженные из Восточно-Черноморской впадины, перекрывают эту ступень. Более точную датировку начала движений по этому разлому по материалам сейсморазведки установить не удается. Внедрение байосских интрузий по разлому на всем его протяжении от Крыма до Закавказья указывает, что этот разлом существовал уже в среднеюрское время. Можно также предполагать, что в Восточно-Черноморской впадине, также как на суше, прилегающей к Черному морю проявилась триасовая фаза рифтогенеза. В Причерноморье известны грабены, которые относятся к палеорифтам, как, например, триасовые Мендайкейский и Баба-Дагский грабены в Добрудже (Румыния) или триасовый прогиб Горного Крыма. Л.С. Борисенко, например, считает, что поперечные разрывные структуры в Горном Крыму, наиболее ярким представителем которых является разлом Алуштинско-Симферопольской зоны, заложились не позднее триаса.

В пользу предположения, что эти разломы связаны с рифтогенезом,  свидетельствует петрохимические особенности среднеюрских лав, заключающиеся в высоком содержании щелочей при преобладании Na2O над К2О. Как известно, именно щелочные эффузивы характерны для вулканизма рифтовых зон, несмотря на разнообразие его состава. Состав магматических образований основной и средний, встречаются и кислые разновидности. Появление значительного количества кварца в магматических породах, связано, в основном, с процессами анатексиса, т.е. частичного расплавления горных пород гранитно-метаморфического слоя при поднятии магматического расплава. Об этом свидетельствуют неустойчивость петрографического состава, появление необычных акцессорных минералов (напрмер, сфена) и развитие метосамотоза. Надо полагать, что анатексис особенно ярко проявлялся на окончаниях рифтовых систем, как, например, на северном окончании Восточно-Черноморской рифтовой системы, представленной поперечными грабенами типа Салгирского и системой поперечных разломов в Горном Крыму. Эти данные по магматизму поперечных структур Горного Крыма хорошо совпадают с обобщенными данными по магматизму континентальных рифтов, который, в отличие от океанических рифтов, чрезвычайно разнообразен и в этом отношении он может быть сопоставлен только с островными дугами. Наверное, это разнообразие создается анатексисом.